Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms