Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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PTPROQ16827 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
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PTPROQ16827 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPROQ16827 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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PTPROQ16827 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPROQ16827 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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