Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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