Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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E2F4Q16254 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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E2F4Q16254 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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E2F4Q16254 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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