Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VAMP3Q15836 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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