Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CCDC85BQ15834 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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