Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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ALX1Q15699 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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ALX1Q15699 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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ALX1Q15699 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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ALX1Q15699 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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ALX1Q15699 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ALX1Q15699 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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ALX1Q15699 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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ALX1Q15699 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ALX1Q15699 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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