Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1CQ15572 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
TAF1CQ15572 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1CQ15572 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1CQ15572 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1CQ15572 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1CQ15572 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TAF1CQ15572 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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