Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CNN3Q15417 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNN3Q15417 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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