Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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NECTIN1Q15223 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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NECTIN1Q15223 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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