Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LAPTM4AQ15012 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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