Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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RAB39AQ14964 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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