Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ERV3-1Q14264 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms