Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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TUBA3CQ13748 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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TUBA3CQ13748 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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