Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRSQ13332 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRSQ13332 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms