Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN3Q13064 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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