Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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PRDM2Q13029 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PRDM2Q13029 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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PRDM2Q13029 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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PRDM2Q13029 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRDM2Q13029 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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PRDM2Q13029 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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