Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECH1Q13011 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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