Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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