Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TTPAP49638 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
TTPAP49638 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
TTPAP49638 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TTPAP49638 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TTPAP49638 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms