Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VPREB1P12018 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms