Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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