Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GDE1Q9NZC3 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms