Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TIMMDC1Q9NPL8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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