Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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CDO1Q16878 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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CDO1Q16878 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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CDO1Q16878 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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