Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNAPC1Q16533 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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