Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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GRIK5Q16478 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK5Q16478 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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GRIK5Q16478 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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GRIK5Q16478 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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GRIK5Q16478 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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GRIK5Q16478 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK5Q16478 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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