Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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