Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHHQ15465 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHHQ15465 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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