Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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