Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms