Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF235Q14590 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms