Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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