Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PRPF4BQ13523 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PRPF4BQ13523 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PRPF4BQ13523 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PRPF4BQ13523 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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