Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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