Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SP140Q13342 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SP140Q13342 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SP140Q13342 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SP140Q13342 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SP140Q13342 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SP140Q13342 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SP140Q13342 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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