Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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