Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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TRAF1Q13077 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF1Q13077 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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