Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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NFIAQ12857 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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NFIAQ12857 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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NFIAQ12857 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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NFIAQ12857 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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NFIAQ12857 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NFIAQ12857 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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