Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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KCNMA1Q12791 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
KCNMA1Q12791 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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