Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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PTPRBP23467 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRBP23467 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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