Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ANKRD28O15084 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ANKRD28O15084 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms