Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SOBPA7XYQ1 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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