Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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