Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
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CCDC47Q96A33 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC47Q96A33 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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