Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SLC27A3Q5K4L6 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SLC27A3Q5K4L6 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SLC27A3Q5K4L6 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SLC27A3Q5K4L6 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SLC27A3Q5K4L6 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms