Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms