Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms