Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNCBQ16143 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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