Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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SCN9AQ15858 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SCN9AQ15858 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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